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严格地说菌根和根颈不是果树根系真正的组成部分，但二者的功能和作用是与根系紧密联系在一起的。
1.菌根：是菌类在果树根尖的寄生现象所形成的共生物。对果树根系的吸收功能产生有利作用。菌根能分泌激素和酶类，活化根系生理功能，促进根系生长、活动和吸收。还能分解腐殖质，释放二氧化碳形成碳酸，增加土壤有机营养，中和土壤的碱性，提高土壤养分的有效性。特别是能帮助果树根系吸收一般根不能吸收和利用的水分，与果树的抗旱性密切相关。有的菌根还有固氮作用，能把果树不能利用的一些氮素营养转化成可利用的状态，提供给果树吸收利用。
2.根颈：是指果树地上部与地下部相交接的地方，是树体上下营养物质交流必经的通道和关口。实生繁殖的果树为真根颈，用枝、根等无性繁殖的果树为假根颈。
根颈是果树器官中生理机能非常活跃的部分。冬季进入休眠最晚，春季解除休眠最早，对外界气候和环境变化反应十分敏感。因此，管理不当容易发生冻害和日烧，引起腐烂和病虫害。栽培上要求树苗栽植时，根颈应与地面相齐，深埋和裸露对树体生长发育均不利。在北方冬季寒冷区，应注意埋土和包扎保护，以防发生冻害、日烧和鼠害。
1、科学家作了这样一组实验：在相同的生长条件下同时种植了两株一样的植物，一段时间后，观察它们的生长情况，竟有这么大的差异！这是什么原因呢？科学家欣喜地解释：这是他们对植物动了手脚，应用了一种先进的生物技术-----菌根生物技术。
2、原来早在三亿年以前，植物在自然生长过程中，不断进化，已形成了一种特有的自然生活供养体系，植物依靠它获得生长所必须的养分和水分，这个重要的自然生活供养体系被称为菌根。
3、菌根就是真菌加植物根，确切地说，它是土壤中特有的真菌与植物根的共生联合体。植物有了菌根，就可以通过无数细长菌丝和菌索吸收土壤中的营养和水分，扩大根系的吸收面积，提高吸收能力。菌根分泌的多种酶，能分解土壤中的有机物和矿物质，并把它们转化为植物能吸收的养分。菌根还能产生多种植物激素和生长调节物质，调控植物生理活动，促进植物健康的生长，提高植物的抗病性和生存能力。菌根的形成，提高了土壤活性和肥力，改良了土壤。在自然条件下，许多植物没有菌根就很难正常生长。
4、自20世纪50年代，菌根对植物的效能被发现以来，引起了各国科学家的关注。研究发现，由于地球生态环境的逐渐改变，植物在自然条件下已很难形成菌根。在农、林及环保领域内，如何利用菌根人工生物技术，帮助植物在不同的环境成活、生长，是既有重大理论价值又有广阔应用前景的新课题。
在林木菌根研究方面，中国林业科学研究院林业研究所取得了很大成功。80年代末，他们就首次在国内研制成功了菌根剂。今年，我国首条菌根剂生产线已宣告落成。目前，这种菌根剂已在林业、农业、园林、土地复垦、环保等方面不断推广，取得了显著效果。
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